Термофильные лактобациллы и стрептококк используют в производстве твердых сыров с высокими температурами II нагревания. Исследования на 8 заводах по производству сыра Эмменталь в Швейцарии показали, что фаги термофильных лактобактерий могут появляться в больших количествах в производственных заквасках, сыворотке и непосредственно в сырах. В кислотообразовании во время выработки этих сыров вплоть до II нагревания активное участие принимают лактококки, на которые фаги термофильных лактобактерий не действуют. Действие фагов термофильных бактерий начинает сказываться не во время выработки крупных сыров в ванне, а позднее, во второй половине их прессования, поэтому оно может и остаться незамеченным. Однако снижение скорости развития термофильной микрофлоры создает условия для более интенсивного развития посторонней микрофлоры и ведет к снижению качества сыра.