Должная активность молочнокислых бактерий в производстве любого сыра - необходимое условие получения качественного продукта. Наиболее частой и трудноустранимой причиной снижения активности молочнокислой микрофлоры заквасок в сыроделии является бактериофаг.
Фаги молочнокислых бактерий попадают на заводы с молоком, пастеризация молока их уничтожает не полностью. На заводах идет активная репликация фагов даже при нормальной скорости молочнокислого брожения, поскольку у фагорезистентных штаммов в процессе размножения часть клеток становится чувствительной к фагам. Особенно высокое содержание бактериофагов бывает в сыворотке и в производственных заквасках при нарушении санитарных правил их приготовления. Сыворотка и производственные закваски - главные источники фагов на производстве.
Для предупреждения фаголизиса микрофлоры закваски необходима полная изоляция помещений, в которых готовят закваски, от остальных помещений, особенно сыродельных и мест хранения и переработки сыворотки. Альтернативой может быть приготовление заквасок в герметичных заквасочниках с небольшим избыточным давлением внутри заквасочника, создаваемым непрерывной подачей стерильного воздуха, и оборудованных устройствами для асептического внесения инокулята. Практически полностью решает проблему бактериофага внесение бактериальных концентратов непосредственно в сырную ванну, т. е. без приготовления на заводе производственных заквасок.
Важную роль в защите микрофлоры заквасок от действия бактериофага играет повышение фагорезистентности входящих в ее состав штаммов.