Подготовка молока, включая тепловую обработку, проводится с целью улучшения его свойств как среды для развития микрофлоры закваски и субстрата для молокосвертывающих энзимов, максимального освобождения от патогенных и технически вредных микроорганизмов, удаления механических загрязнений. Улучшение молока как среды для развития микрофлоры закваски состоит в дезактивации природных антибактериальных систем молока, образовании небольших количеств низкомолекулярных пептидов и свободных аминокислот, необходимых для стартового развития лактобактерий, снижении Eh. Улучшение указанных свойств молока происходит при созревании молока или хранении сырого молока при 8-10° С.
Повышение кислотности молока до 18-18,5° Т во время созревания или хранения, обогащение молока Са2+, в некоторой степени вакуумирование улучшают сычужную свертываемость молока. Пастеризация и термизация молока предназначена для уничтожения патогенной и технически вредной микрофлоры. Кроме этого, во время хранения молока при температурах ниже 8° С мицеллы казеина сильно изменяются, что ухудшает сычужную свертываемость и выход сыра. Пастеризация перед выработкой сыра частично устраняет дефекты молока, возникающие во время холодильного хранения. Гомогенизация молока стимулирует липолитические процессы, что очень важно для формирования специфических органолептических показателей плесневых сыров.
В период после выхода молока из вымени и до начала выработки из него сыра технология его обработки должна предотвратить или максимально ограничить размножение патогенной и технически вредной микрофлоры, в частности психротрофной. Предотвратить размножение психротрофов можно путем резервирования и созревания пастеризованного молока с термизацией перед началом переработки, обработкой молока углекислым газом.